sjd-chemistry sjd-info-comp sjd-biology : biologie chemie humanmedizin informatik (doktorarbeit): inhibition von coiled coil proteinen und deren einfluss auf tumorzellwachstum

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Fachgebiete:     Biologie Chemie Humanmedizin Informatik
Thema:           Doktorarbeit: Inhibition von Coiled Coil Proteinen und deren Einfluss auf Tumorzellwachstum
Ansprechpartner: Dr. rer. nat. Katja Arndt
Antwort an:      katja@biologie.uni-freiburg.de
Institution:     Biologie III (Genetik und Molekularbiologie)
Ort:             79104 Freiburg, Germany, Schänzlestr. 1
 
 
Zwei Hauptursachen menschlicher Krebserkrankungen sind die Fehlregulierung von Proteinen und die Bildung von Fusionsproteinen durch Chromosomentranslokationen. Unser Ziel ist die Entwicklung kleiner Peptide, die diese Proteine blockieren, um damit den physiologischen Zustand der Zelle wiederherzustellen. Freie Stellen stehen für zwei Projekte zur Verfügung:
$-1ó¢  Untersuchung der zellulären Effekte AP-1 und Myc-gerichteter Inhibitoren
$-1ó¢  Entwicklung von Peptiden, die AML1-ETO, ein Leukämie-spezifisches Fusionsprotein, binden.
 
Methoden:
Wir verwenden eine Kombination aus rationalen Designstrategien und evolutiven Systemen, gefolgt von einer biochemischen, biophysikalischen und zellbiologischen Charakterisierung. Hierbei greifen wir auf ein breites Methoden-Spektrum zurück: Molekularbiologie, Selektionstechniken, Proteinbiochemie, biophysikalische Meßmethoden, Zellkultur, Bioinformatik und Proteomics. Erfahrungen in einem oder mehreren dieser Bereiche sind wünschenswert. 
 
Anfangsdatum: 1. August 2007
 
geschätzte Dauer: 3 Jahre
 
Bezahlung: BAT IIa/2 bzw. E13/2
 
Veröffentlichungen:
Mason, J.M., Müller, K.M. & Arndt, K.M. (2007) Positive Aspects of Negative Design: Simultaneous Selection of Specificity and Interaction Stability. Biochemistry 46, 4804-4814
 
Mason, J.M., Schmitz, M.A., Müller, K.M. & Arndt, K.M. (2006) Semirational design of Jun-Fos coiled coils with increased affinity: Universal implications for leucine zipper prediction and design. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(24), 8989-8994.
 
Mason, J.M. & Arndt, K.M. (2004). Coiled coil domains: stability, specificity, and biological implications. ChemBiochem 5(2); 170-6.
 
Jouaux, E.M., Willemsen, T. & Arndt, K.M. (2004). Der richtige Dreh - Coiled Coils auf dem Weg zur Anwendung. BioForum 10; 48-49.
 
Homepage: http://www.molbiotech.uni-freiburg.de/ka
 
Wenn Sie Spaß an der Forschung haben, an einem breiten Methodenspektrum interessiert sind und eigenständig auf einem interessanten und medizinisch relevanten Thema arbeiten wollen, sollten Sie sich bewerben. Bewerbungen sollten einen Lebenslauf, eine kurze Zusammenfassung der Forschungsinteressen und Methodenkenntnisse sowie zwei Referenzen mit Adresse beinhalten. 
 
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